Shinjuku et Shibuya offrent les meilleures connexions de transports (plusieurs lignes de train s'y croisent) et conviennent aux primo-visiteurs. Asakusa dispose de l'atmosphère la plus traditionnelle près du Senso-ji. Ginza est haut de gamme et central. Pour les séjours économiques, les hôtels capsules de Shinjuku constituent une expérience authentiquement japonaise à essayer au moins une fois.
Akihabara plaît aux amateurs de technologie et d'anime ; Shimokitazawa attire la foule indépendante. Les chaînes d'hôtels d'affaires (Toyoko Inn, Dormy Inn) proposent des chambres propres et fiables avec onsen entre 60 et 90 dollars la nuit. Les hôtels de luxe — Park Hyatt (Lost in Translation), Aman Tokyo, The Peninsula — sont de classe mondiale si le budget le permet.